распаковываем приложение

apktool d test.apk

advance,–advanced печатает предварительную информацию.. -version,–version печатает версию, затем выводит параметры: apktool if|install-framework [options] <framework.apk>

• -p,–frame-path <директория> Сохраняет файлы фреймворка в <директорию>.
• -t,–tag <tag> Отметьте фреймворки, используя <tag>.

параметры декодирования: apktool d[ecode] [options] <file_apk>

• -f,–force Принудительно удалить каталог назначения.
• -o,–output <директориия> Имя папки, в которую все записывается. По умолчанию это apk.out
• -p,–frame-path <директориия> Использует файлы фреймворка, расположенные в <директориии>.
• -r,–no-res Не декодировать ресурсы.
• -s,–no-src Не расшифровывайте исходники.
• -t,–frame-tag <tag> Использует файлы фреймворка, помеченные <tag>.

параметры сборки: apktool b[uild] [options] <app_path>

• -f,–force-all Пропустить обнаружение изменений и собрать все файлы.
• -o,–output <директориия> Имя apk, которое записывается. По умолчанию это dist/name.apk.
• -p,–frame-path <директориия> Использует файлы фреймворка, расположенные в <директории>.

запаковываем приложение

apktool b ./test

b - build, собрать apk

test - в данном случае это папка

В версии 2.0.0-Beta7 нужно применять ключ –output, чтобы указать директорию при декомпиляции и результирующий файл при сборке:

apktool decode orig.apk --output orig
apktool build orig --output result.apk