Для открытия реестра используется инструмент regedit:

wine regedit

Чтобы перемещаться по реестру, кликните на ключах в левой части панели, чтобы перейти на следующий уровень глубины. 

Чтобы удалить ключ, кликните на нем и в меню Edit выберите «Delete». 

Чтобы добавить ключ или значение, определите место, где вы хотите поместить его, и выберите «New» из меню «Edit». 

Чтобы изменить существующий ключ, выделите его в правой панели и выберите «Modify» из меню «Edit». Другой способ проделать то же самое, это щелчок правой кнопкой мыши на ключе или значении.

Файлы реестра располагаются в папке префикса, например:

/home/$USER/.wine_prefix/

• system.reg — содержит ветвь HKEY_LOCAL_MACHINE;
• user.reg — HKEY_CURRENT_USER;
• userdef.reg — HKEY_HKEY_USERS\.Default (содержит настройки Windows пользователя по умолчанию).