Создай пустой префикс, запусти winetricks dotnet40 или winetricks dotnet45 в консоли и следуй инструкциям. Для верности попробуй и 32-разрядный префикс, и 64-разрядный (32-разрядный префикс создавать с нуля командой WINEARCH=win32 winecfg, подчёркиваю, создавать с нуля).

дотнет не ставится в x64 префикс

rm -rf ~/.wine
export WINEARCH=win32
wineboot -i